Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP35Q9P2H5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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