Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC180Q9P1Z9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms