Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms