Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNIH4Q9P003 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNIH4Q9P003 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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