Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms