Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms