Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms