Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAPERQ9BY12 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms