Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TDRD1Q9BXT4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDRD1Q9BXT4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 934.3 ms