Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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