Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOL4Q9BPW4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms