Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDC1Q96MU7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms