Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms