Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms