Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SDCCAG3Q96C92 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDCCAG3Q96C92 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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