Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC1Q96C34 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms