Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-CQ95604 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms