Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms