Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRUQ92729 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms