Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN4Q92575 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms