Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GIPC3Q8TF64 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms