Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNDC1Q76NI1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms