Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms