Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
REEP3Q6NUK4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms