Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRNP1Q6NT89 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms