Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WSCD1Q658N2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms