Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD3Q5T2D3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OTUD3Q5T2D3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
OTUD3Q5T2D3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
OTUD3Q5T2D3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms