Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms