Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms