Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A52Q3SY17 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A52Q3SY17 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms