Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EDRF1Q3B7T1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms