Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5B1Q2VPB7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms