Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CSPP1Q1MSJ5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSPP1Q1MSJ5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms