Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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