Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATP6V1FQ16864 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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