Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RTN1Q16799 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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