Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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