Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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