Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECM1Q16610 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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ECM1Q16610 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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ECM1Q16610 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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ECM1Q16610 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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ECM1Q16610 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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ECM1Q16610 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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ECM1Q16610 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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