Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC18A3Q16572 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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