Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
USF2Q15853 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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