Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms