Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP4Q15650 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms