Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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TRIP10Q15642 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms