Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms