Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEA1Q15075 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms