Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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LAPTM4AQ15012 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAPTM4AQ15012 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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