Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms