Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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