Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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